Ανάμεσα στους ανεκτίμητους θησαυρούς που έχουν τα Κύθηρα είναι και τα αμέτρητα σπήλαια, με πρώτο και καλύτερο ανάμεσά τους το σπήλαιο του Μυλοποτάμου που είναι και το μεγαλύτερο και το πιο διακοσμημένο.
Το 1930 ασχολήθηκε μ’ αυτό ο διαπρεπής Κυθήριος σπηλαιολόγος Γιάννης Πετρόχειλος. Το 1955 χαρτογραφήθηκε από τη γυναίκα του, σπηλαιολόγο Άννα Πετροχείλου. Η έκταση του σπηλαίου είναι περίπου 2000 τ.μ. και το επισκέψιμο τμήμα είναι περίπου 200 μ.
Μέσα στο σπήλαιο, όπως και στα πλείστα σπήλαια των Κυθήρων, υπάρχει ναός της αγίας Σοφίας.
Η ονοματοδοσία στις 8 εντυπωσιακές αίθουσες του σπηλαίου οφείλεται στο Γιάννη Πετρόχειλο. Έτσι μια παραμυθένια αίθουσα με φυσικές λεκάνες γεμάτες νερό ονομάστηκε “Λουτρά της Αφροδίτης” Άλλες αίθουσες είναι η αίθουσα των Κεχριμπαριών, η αίθουσα του Βαρελιού, η αίθουσα των Νυχτερίδων, η αίθουσα της Κρυφής Λίμνης.
Σε πολλούς σταλακτίτες τα κόκκινα και κίτρινα χρώματα οφείλονται στο σίδηρο.